食用菌工厂化生产是我国现代农业和生物农业的新亮点，在发达国家工厂化食用菌生产比例已高达90%。而相对于传统生产模式，我国食用菌工厂化生产则刚刚起步，近年来，工厂化食用菌产业在我国年均增速在12%～15%左右。
以工厂化金针菇数据为例，2003年，我国工厂化金针菇每日产量仅40吨；2010年，已上升至每日722吨；到2011年，这一数据攀升至841吨，8年来翻了20倍，呈现爆发性增长趋势。与此同时，杏鲍菇从2005年日产4吨到2011年日产117吨，蟹味菇产量也同样大幅增长，从2003年日产不足2吨达到2011年日产121吨。
从地区来看，2011年上海金针菇工厂化产量可达日产142吨，同比2010年增长63%；杏鲍菇工厂化产量日产19吨，蟹味菇日产56吨，分别比2010年增长36%和195%，走在国内食用菌工厂化产业发展的前列。
记者从工厂化食用菌生产企业获悉，2010年，工厂化食用菌的平均毛利率在50%左右，并且根据相关税法规定，工厂化食用菌生产企业从事农业项目的所得免征企业所得税、自产自销农业产品免征增值税，企业几乎没有税收负担，故了较高的净利润率。
目前，食用菌工厂主要集中在上海、广东、北京和河南等地。2007年开始，一些大型企业为了更大范围销售产品，同时为了降低成本，开始从大城市周边向其他省市战略性扩张，选择资源优越，交通便利，投资政策更好的地区落户。
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